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精准医疗、空间组学,细胞图谱,腾讯 AI Lab 用深度学习助力生命科学研究

查看 cc博主 的更多文章cc博主2023-02-21【业界】317人已围观

近日,腾讯 AI Lab 三项研究分别入选国际顶级学术期刊 Nature Methods 和 Nature Communications,再次展示了在生命科学前沿领域上国际领先的技术实力。

这三项研究成果都属于生物细胞研究中的空间组学技术,对于推动精准医疗、细胞图谱绘制、人类生命健康等领域的研究具有重要意义。

据介绍,空间组学技术是高通量转录组测序、单细胞测序等技术的升级,它通过在细胞分析中,增加「空间」这一重要的信息维度,使得研究员可以从更全局、立体、精细地认识生物系统的运行规律。

通过深度学习等人工智能技术的引入,近年来空间组学技术领域不断迎来新的突破,本次腾讯AI Lab的三项成果,分别从细胞类型注释、微环境建模以及数据库三个方面重点突破,并在准确率、数据规模以及方法创新性上均展示了超出业界标准的水平,推动国际学术社区和相关研究的发展。它们分别是:

  • 一种基于迁移学习和空间嵌入的空间转录组细胞类型注释方法 Spatial-ID

  • 一种利用空间组学数据进行微环境建模的通用方法 SOTIP

  • 一个超过5000万细胞、26个种类的空间组学数据库

在空间组学相关技术上,腾讯 AI Lab 的核心攻坚方向和优势在于AI算法研究。长期以来,腾讯 AI Lab 与业内知名研究所和医院广泛合作,实现在生命科学的研究和临床场景中落地,具体应用包括建立细胞图谱,尤其是灵长类大脑图谱,促进脑科学的研究。临床方面,腾讯AI Lab通过空间组学研究肿瘤的微环境和发展轨迹,助力推进精准医疗的实现。

腾讯在医疗及生命科学领域已有多项探索。2022年,腾讯 AI Lab 联合北京协和医院,共同发布了便携式智能化手术导航系统,临床初步应用取得成功。此外,实验室也创新性地提出关于单细胞注释的 scBERT 算法,成果发表于国际顶级学术期刊《Nature Machine Intelligence》杂志。

Nature Methods 是Nature(《自然》)系列期刊中的关注前沿科学研究的期刊,每年评选生命科学领域的年度方法,2022年期刊影响因子 47.99,在生物研究方法领域排名第一。Nature Communications 是 Nature(《自然》)系列期刊中的综合类子刊,专门收录来自于自然科学各个领域的高质量研究成果,2022年期刊影响因子 17.69,在综合类期刊中位列第三。

 

三项研究链接:

1: 一种基于迁移学习和空间嵌入的空间转录组细胞类型注释方法 Spatial-ID

(Nature Communications: https://www.nature.com/articles/s41467-022-35288-0)

2 :一种利用空间组学数据进行微环境建模的通用方法 SOTIP

(Nature Communications: https://www.nature.com/articles/s41467-022-34867-5)

3 : 超过5000万个细胞、26个种类空间组学数据库

(Nature Methods: https://www.nature.com/articles/s41592-023-01773-7)

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